Nature一周论文导读年9月2
审校小勺紫苏小象 制版阿金 生物学 Biology PathsandtimingsofthepeoplingofPolynesiainferredfromgenomicnetworks 基因组网络推断波利尼西亚人迁移的路径和时间 (导读阿金)波利尼西亚人跨越海洋后定居岛屿的路径和时间尚未完全确定。本研究使用来自21个太平洋岛屿的名现代人全基因组数据,揭示了太平洋地区分布广泛岛屿定居网络的详细基因历史。研究人员重构了波利尼西亚人迁移的分支,描述了扩张起始和基因变种的定向丢失。从萨摩亚开始,向库克群岛扩张,然后是社会群岛、西澳群岛和土阿莫土群岛,最后遍布东南西北诸岛,分散广泛但基因仍相连。[相关报道:飘洋过海的基因组:波利尼西亚人迁移的路径和时间] Rarevariantcontributiontohumandiseasein,UKBiobankexomes 英国Biobank,个外显子组中发现的与人类疾病相关的罕见变异 (导读郭怿暄)本研究利用英国Biobank中欧洲谱系的外显子测序数据,研究罕见的蛋白质编码变异与个二元和个数量性表型的关系发现个具有统计学显著性的二元性状的基因-表型关联,比值比中位数为12.4,其中83%无法在单个变异相关检验中检出。基因-表型关联在丢失功能介导的性状和获批的药物靶点中显著富集。该研究表明罕见变异在常见疾病中发挥重要作用。[相关报道:外显子“生物银行”揭开人类疾病中罕见突变的贡献] Bioaccumulationoftherapeuticdrugsbyhumangutbacteria 人类肠道细菌对治疗药物的生物蓄积 (导读一晴)肠道中的细菌可以调节药物的疗效。然而,对药物和细菌相互作用的系统定位还不成熟。近期,研究人员利用25株肠道代表性菌株消耗15种结构多样的药物,揭示了70种细菌与药物的相互作用,其中29种是从未报道过的。超过一半的新相互作用可以归因于生物积累,也就是说,细菌将药物储存在细胞内。总之,肠道细菌的生物积累可能是改变药物可用性和细菌代谢的一种常见机制,可能以特定方式影响微生物群组成、药代动力学、副作用和药物反应。[相关报道:药吃不少,不见疗效?Nature:可能让肠道细菌给吃了...] ResurgenceofEbolavirusininGuineasuggestsanewparadigmforoutbreaks 年几内亚埃博拉病毒的卷土重来提供流行病暴发新范式 (导读阿金)年6月几内亚再一次暴发新一轮的埃博拉病毒大流行。本研究通过12名患者提供的扎伊埃博拉病毒样本,使用下一代测序生成完整或近乎完整的病毒基因组,与七年前暴发的病毒基因组构成完整的系统发育簇,表明新一轮暴发并非来自动物身上的病毒溢出事件。埃博拉病毒的卷土重来强调了需要加强患者长期的疫疗和社会护理,减少流行病再暴发的风险。[相关报道:埃博拉病毒潜伏期可长达至少5年] AnengineeredIL-2partialagonistpromotesCD8+Tcellstemness 经改造的IL-2部分激动剂促进CD8+T细胞干性 (导读阿金)抗原特异性T细胞的适应性转移是癌症免疫疗法的重大突破。本研究表明,一种生物工程改造的白细胞介素-2部分激动剂H9T能促进CD8+T细胞的增殖,同时不会驱动末端分化。H9T改变STAT5信号传导,介导不同的下游转录、表观遗传和代谢程序,维持T细胞转录因子1的表达,从而保持干细胞样状态。因此,经改造的细胞因子变体有潜力成为具有转化潜力的新分子。[论文详细信息] Inter-cellularCRISPRscreensrevealregulatorsofcancercellphagocytosis 细胞间CRISPR筛选揭示癌细胞吞噬作用的调节因子 (导读一晴)针对肿瘤抗原的单克隆抗体治疗主要通过触发巨噬细胞吞噬癌细胞来驱动癌细胞的消除。然而,目前尚不完全了解癌细胞逃避吞噬作用的机制。研究者开发了一个通过全基因组CRISPR敲除和过表达筛选平台,在癌细胞和巨噬细胞中准确识别阻碍抗体依赖性细胞吞噬(ADCP)的因子。除CD47等已知因子外,发现了许多易感ADCP的调节因子,包括酶脂肪细胞膜相关蛋白(APMAP)。研究结果促进了对癌症抵抗巨噬细胞吞噬机制的认识。[论文详细信息] UsingDNAsequencingdatatoquantifyTcellfractionandtherapyresponse 使用DNA测序数据量化T细胞分数和治疗反应 (导读郭怿暄)本研究开发出T细胞外显子组TREC工具(T细胞ExTRECT),利用T细胞受体α基因(TCRA)V(D)J重组时来自T细胞受体切除环(TREC)信号的丧失,评估来自全外显子组测序(WES)样本的T细胞分数。女性血液的TCRAT细胞分数高于男性,并与肿瘤免疫浸润和细菌测序读数相关。肿瘤TCRAT细胞分数与肺腺癌预后相关,可预测免疫治疗应答。将T细胞ExTRECT应用于多样品泛肿瘤序列显示肿瘤内免疫浸润程度存在极高多样性。[论文详细信息] Single-cellRibo-seqrevealscellcycle-dependenttranslationalpausing 单细胞Ribo-seq揭示细胞周期依赖性翻译暂停 (导读郭怿暄)本研究基于现有方法,增强实验敏感性,实现了单细胞中的核糖体分析。结合机器学习方法,该技术可达到单个密码子分辨率。研究通过证明特定氨基酸限制导致核糖体在一部分密码子处发生暂停验证了该方法的有效性。研究将该方法扩展到非限制性条件,检测到有丝分裂中显著的GAA暂停,而且还可以用于罕见的原代肠内分泌细胞中。该技术为理解相同细胞在翻译过程表现出的多样性奠定基础。[相关报道:单密码子分辨率翻译测序新方法—scRibo-seq] StructuralbasisfortRNAmethylthiolationbytheradicalSAMenzymeMiaB 自由基SAM酶MiaB介导tRNA甲基硫醇化的结构基础 (导读阿金)转移RNA的许多转录后修饰在翻译过程中发挥关键作用。本研究报告了单形拟杆菌S-腺苷蛋氨酸(SAM)甲基转移酶MiaB的若干结构,所有结构都符合两步机制:第一步一个SAM分子被用来甲基化辅助团簇的一个桥接μ-硫代离子,随后第二个SAM分子被裂解为一个5-脱氧腺苷5-自由基,以分离杂化后底物的C2氢。该结构解析加深了对酶用硫将惰性C-H键功能化的理解。[论文详细信息] PositiveallostericmechanismsofadenosineA1receptor-mediatedanalgesia 腺苷A1受体介导镇痛的正向变构机制 (导读阿金)腺苷A1受体(A1R)是治疗神经性疼痛非阿片类镇痛剂的有效靶点。本研究揭示发现A1R的一个正向变构调控因子MIPS通过调节神经痛大鼠脊髓内内源性腺苷水平实现镇痛。同时还解析了A1R同时结合腺苷、MIPS和Gi2异源三聚体的结构,揭示了脂质面向去垢剂的超螺旋变构结合口袋。该结果提供了非阿片类镇痛剂结构变构设计思路的概念性证明。[论文详细信息] Howderegulation,droughtandincreasingfireimpactAmazonianbiodiversity 放松管制、干旱和日益严重的火灾影响亚马逊生物多样性 (导读阿金)生物多样性有助于维持亚马逊盆地的生态和气候稳定性。本研究量化了过去二十年内火灾、森林砍伐对亚马逊动植物的影响情况。发现森林砍伐造成栖息地大量丧失,而森林大火进一步加剧对生物多样性的影响。从年起,亚马逊雨林受大火影响面积广泛,威胁到该地77.3-85.2%的受胁物种。而且森林管理政策、森林火灾影响区域和对生物多样性的潜在影响三者之间具有相关性,强调了加强森林管理对保护生物多样性的关键作用。[论文详细信息] 天文学 Astronomy Quenchingofstarformationfromalackofinflowinggastogalaxies 缺乏流入星系的气体导致恒星形成淬灭 (导读阿金)在宇宙诞生后30亿年时,一半大质量星系中的恒星形成被停止下来。这可能是分子气体量过低造成的。本研究报告了对6个恒星形成遭淬灭的强透镜星系的气体尘埃发射的1.3毫米观测。其中4个星系无法在尘埃发射中被检测到,且尘埃质量的上限估计只有恒星质量的万分之一。观测结果表明气体消耗是某些高红移星系中恒星形成停止的主要原因。[相关报道:早期大质量星系的淬灭或因冷气体不足] Normal,dust-obscuredgalaxiesintheepochofreionization 再电离时代期间被尘埃遮蔽的正常星系 (导读阿金)目前,对于宇宙再电离时代的被尘埃遮蔽的星系群仍有待确认。本研究报告了对发现的两个被尘埃遮蔽但形成恒星的星系的观测结果。这些天体无法在现有的静止帧紫外线数据中被检测到,只能通过其远红外[cII]线和尘埃连续发射中观测。与极端星暴相比,这两个星系的红外光度更低,恒星形成速度也更慢,符合z?≈?7的典型恒星形成星系。[论文详细信息] 物理学 Physics Single-photonnonlinearityatroomtemperature 室温条件下的单光子非线性 (导读阿金)纳米技术和单分子谱学的最新进展为新兴的低成本有机量子光学技术的出现奠定基础。本研究使用与微腔强耦合的π-共轭阶梯型聚合物,形成光-物质混合态,即激子-极化子,创造出具有量子流体特性的激子-极化子凝聚体,在受到玻色子刺激时表现出极端非线性。研究人员继而使用具有高能分子振动的稳定激子,在室温条件下实现单光子非线性运作。该结果为在基础量子极限下的亚皮秒切换、放大和全光学逻辑的应用提供新途径。[相关报道:光学“晶体管”或能让计算机速度提升倍] Electronphase-spacecontrolinphotonicchip-basedparticleacceleration 基于光子芯片的粒子加速中电子相-空间控制 (导读阿金)粒子加速器在科学、医疗及工业中有重要的应用价值。本研究在77.7微米长的硅基光子纳米结构窄通道内实现符合光学频率的复杂电子相-空间控制。在实验条件下,展示了交替相位聚焦。研究人员希望这一研究成果能够在光子芯片上生成兆电子伏特的电子束,从而有潜力应用于放射疗法和致密光源,以及其他电子相-空间控制形式。[论文详细信息] 其他 Three-dimensionalelectronicmicrofliersinspiredbywind-dispersedseeds 受风传种子启发的三维电子微型飞行器 (导读阿金)微型无线电子设备有潜力应用于未来环境监测、疾病管理等系统。本研究受风传种子的启发,检验了适用于自然或城市环境的无动力控制飞行被动式飞行结构设计,提出一系列包含主动电子载荷和比色载荷的三维大型、中型和微型飞行器。该类型飞行器高性能结构产生的空气动力学可控制旋转动力学,并保持较低的终端速度。该设计方案可根据应用场景实现多种功能效果。[相关报道:屈曲力学组装的仿风传种子三维微电子飞行器] Three-dimensionalmagneticstripesrequireslowcoolinginfast-spreadloweroceancrust 三维线条状磁场需要在快速传播的海洋下地壳中缓慢冷却 (导读阿金)随着海洋地壳的冷却,地球磁场被记录下来,所产生的线性磁场异常现象揭示了过去1.6亿年的磁极倒转模式。本研究表明岩浆稳定快速传播地壳的磁结构要求接近岩脉-辉长岩转变的地壳温度在10万年内保持在摄氏度。而具有多种极性成分的样本直接证明了约一千米宽区域内对应的水平极性边界,表明存在缓慢冷却过程。该结果揭示了岩浆快速传播的海洋地壳中存在炙热的宽轴区域,且偏轴延伸约8千米。[论文详细信息] 本文来自 |
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